Объяснение гербовой символики:Серебряная раковина доисторического моллюска (наутилуса) в голубом поле символизирует находящийся на территории муниципального образования Дарвиновский музей - крупнейший зоологический музей Москвы. Жезл Меркурия символизирует расположение на территории муниципального образования главного здания Сберегательного банка России. Черный академический головной убор в золотой главе символизирует ряд находящихся на территории муниципального образования научно-исследовательских институтов и иных научных учреждений, а также отражает название муниципального образования.

Официальное описание флага:
Флаг муниципального образования Академическое представляет собой двустороннее, прямоугольное полотнище с соотношением сторон 2:3. Полотнище флага состоит из верхней желтой полосы, ширина которой составляет 7/20 ширины полотнища, и двух равновеликих нижних частей: прилегающей к древку голубой и зеленой. В центре желтой полосы помещено изображение черного академического головного убора, габаритные размеры которого составляют 3/8 длины и 9/40 ширины полотнища. В центре голубой части помещено изображение белой раковины доисторического моллюска (наутилуса), габаритные размеры которого составляют 1/4 длины и 7/16 ширины полотнища. В центре зеленой части помещено изображение желтого жезла Меркурия, габаритные размеры которого составляют 5/24 длины и 9/16 ширины полотнища.

(утверждены решением муниципального Cобрания ..200 №)